探索角膜新生血管形成：在碱烧伤小鼠模型中使用转录组学和蛋白质组学的综合方法。

• 作者：Yiyong Qian，上海十院眼科
  
• 目的：
  
  • 角膜新生血管损害角膜透明度和视力。
    
  • 该研究旨在加深对碱烧伤诱导新生血管相关分子的理解，促进更好地掌握新生血管机制，并发现潜在的治疗靶点。
    
• 方法：
  
  • 模型：小鼠，碱烧伤。
    
  • 烧伤后3、7、14天进行角膜炎观察和组织学检查
    
  • 对正常角膜进行基于RNA测序的转录学和无标记定量蛋白质组学的综合分析。
    
  • 应用生物信息学方法，包括GO、KEGG分析，识别差异表达基因DEG和关键信号通路，使用qRT-PCR和WB验证四个潜在的新生血管相关基因。
    
• 结果：
  
  • 在第七天观察到显著的新生血管
    
  • 41个基因在新生血管化的角膜中存在差异表达，其中15个基因在mRNA和蛋白质水平上表达上调，26个基因表达下调。
    
  • 生物信息学分析表明，这些DFG参与多种生物过程，包括视黄醇和视黄酸代谢、中性粒细胞趋化性和肌动蛋白丝组装，以及细胞色素P450、酪氨酸和苯丙氨酸代谢等重要的富集途径。
    
  • 拎包细胞胞质蛋白1和富含办光氨酸和甘氨酸的蛋白2基因上调，转谷氨酰胺酶2和转化生长因子-β诱导基因下调。
    
• 结论：
  
  • 碱烧伤7天后小鼠角膜中基因表达差异，发现41个基因表达发生改变。
    
  • 这些基因在CNV中的确切作用尚不清楚，但探索血管生成相关分析为CNV治疗或预提供了潜力。