：角膜在强大的昼夜节律控制下运行，对眼表稳态至关重要。缺氧应激在许多眼部疾病和全身性疾病中普遍存在，他会扰乱这些节律，损害上皮、神经和免疫平衡。在此，我们研究环境性缺氧（EH）和化学性缺氧（CH）如何重塑角膜生物钟基因表达和组织完整性。
方法：将雄性C57BL/6J小鼠暴露与常氧（NC）、环境性缺氧（10%氧气）或化学性缺氧（氯化钴，15mg/kg/day，腹腔注射）环境中14天。在24小时周期内，每隔3小时收集一次角膜用于Bulk RNA seq。通过Jonckheere - Terpstra - Kendall CYCLE（JTK_CYCLE）鉴定节律基因，并使用GSEA和PSEA评估通路富集情况。通过免疫荧光染色评估上皮连接蛋白（ZO-1和闭合蛋白）、神经标志物（βIII-微观蛋白）和免疫细胞（Ly6G+中性粒细胞、γδT细胞）。
结果：缺氧显著增加了节律性转录本（环境性缺氧中约增加43%，化学性缺氧中增加约35%），超过65%的节律基因出现相位偏移。化学性缺氧特异性地上调核心生物钟基因（Per1、Cry2、Nr1d2、Rora）并下调Per2,这可能是通过HIF-1α介导的机制实现的。环境性缺氧和化学性缺氧均损害了上皮屏障的完整性，降低了角膜神经密度，并改变了免疫细胞浸润，在授时因子时间18（ZT18）是破坏最为严重。此外，化学性缺氧在ZT3是独特地诱导了屏障功能障碍和免疫抑制，表明存在模型特异性的脆弱窗口。
结论
